Atendendo à demanda da comunidade científica, a Fapesp implantou um programa de treinamento das equipes dos Escritórios de Apoio Institucional ao Pesquisador (EAIP). A Fapesp mantém pontos de apoio distribuídos por diversas universidades e instituições de ensino, que funcionam como facilitadores no envio de documentação, além de orientar bolsistas e pesquisadores em questões envolvendo a Fundação. O objetivo desse treinamento é melhorar cada vez mais o atendimento à comunidade científica. Ao implantar uma equipe para cuidar da burocracia, os pesquisadores podem se dedicar às suas pesquisas sem perder o foco. As equipes recebem treinamento sobre todas as etapas, desde o envio de material até a prestação de contas. Com isso, a Fapesp espera diminuir o número de problemas que podem prejudicar o bom andamento de projetos de pesquisa.