São duas as linhas de pesquisa:
- Gestão e Desenvolvimento de Sistemas (Banco de Dados, Engenharia de Software, Gestão de Sistemas de Informação e Interação Humano-Computador)
- Inteligência de Sistemas (Inteligência Artificial, Processamento Gráfico e Reconhecimento de Padrões)
Mais informações podem ser obtidas no edital nº 88/2015 no site da USP.